MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 chromosome

Total Repeats: 2790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008787	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008787	A	7	7	1358	1364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008787	ATT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008787	CAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008787	TTA	3	9	1437	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008787	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008787	GAA	2	6	4899	4904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008787	TA	3	6	6516	6521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008787	TTTTA	2	10	6525	6534	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008787	TAAT	2	8	6557	6564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008787	TAAT	2	8	6566	6573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008787	A	7	7	6584	6590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008787	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008787	TAAAA	2	10	6617	6626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008787	TCA	2	6	6627	6632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008787	TTA	2	6	6645	6650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008787	T	6	6	6664	6669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008787	ATT	2	6	6689	6694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008787	T	6	6	8031	8036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008787	ATTT	3	12	8038	8049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008787	A	7	7	8075	8081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008787	AAG	2	6	16414	16419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008787	A	6	6	16692	16697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008787	CAC	2	6	17296	17301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_008787	AAC	2	6	17302	17307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008787	T	6	6	17396	17401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008787	TAT	2	6	17420	17425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008787	A	7	7	17426	17432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008787	TAA	2	6	17446	17451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008787	AAAT	2	8	17480	17487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008787	A	6	6	17522	17527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008787	TTA	2	6	17528	17533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008787	AAAAT	2	10	19654	19663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008787	TTTA	2	8	19680	19687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008787	T	6	6	20958	20963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008787	AATTTA	2	12	20966	20977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008787	AAAAT	2	10	23478	23487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008787	GTTAA	2	10	23505	23514	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008787	A	6	6	23524	23529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008787	T	6	6	27169	27174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008787	ATT	2	6	27204	27209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008787	T	7	7	27208	27214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008787	A	6	6	27230	27235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008787	TGAT	2	8	27237	27244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008787	CAT	2	6	27260	27265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008787	TAA	2	6	28171	28176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008787	T	6	6	28207	28212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008787	AAGG	2	8	29581	29588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008787	T	6	6	34137	34142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008787	T	6	6	34153	34158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008787	T	6	6	34171	34176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008787	A	7	7	34225	34231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008787	TTA	2	6	34238	34243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008787	TATT	2	8	37452	37459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008787	TTA	2	6	37462	37467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008787	TA	3	6	37472	37477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008787	T	6	6	38570	38575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008787	TAA	2	6	38629	38634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008787	TATAT	2	10	38638	38647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008787	T	6	6	38654	38659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008787	CCA	2	6	38693	38698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008787	TA	3	6	38705	38710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008787	TTTA	2	8	38744	38751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008787	T	6	6	38790	38795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008787	A	7	7	38797	38803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008787	TAG	2	6	38842	38847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008787	TTTTA	2	10	38872	38881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008787	T	6	6	38894	38899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008787	T	6	6	38910	38915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008787	CTTTT	2	10	38926	38935	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_008787	T	6	6	38944	38949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008787	TTA	2	6	38986	38991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008787	TAA	2	6	39075	39080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008787	CTTTT	2	10	39097	39106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008787	GAA	2	6	39129	39134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008787	CTAT	2	8	39145	39152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008787	GGC	2	6	39194	39199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008787	ACA	2	6	39304	39309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008787	TA	3	6	39389	39394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008787	GGTAA	2	10	39408	39417	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008787	GAT	2	6	39456	39461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008787	GCA	2	6	39505	39510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008787	GCA	2	6	39545	39550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008787	CGC	2	6	39552	39557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_008787	GGA	2	6	39560	39565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008787	GAA	2	6	39601	39606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008787	CAG	2	6	39649	39654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008787	TGG	2	6	39808	39813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008787	CTG	2	6	39866	39871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008787	GTT	2	6	39959	39964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008787	GAA	2	6	40103	40108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008787	TGC	2	6	40183	40188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008787	GTC	2	6	40195	40200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008787	TCGTG	2	10	40204	40213	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_008787	AGG	3	9	40303	40311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008787	GAC	2	6	40320	40325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008787	TCA	2	6	40332	40337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008787	AC	3	6	40358	40363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008787	CCT	2	6	40662	40667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008787	TAA	2	6	40683	40688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008787	AT	3	6	40709	40714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008787	TGA	2	6	40749	40754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008787	AGG	2	6	40812	40817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008787	CCA	2	6	40842	40847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_008787	TTA	2	6	40849	40854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008787	A	6	6	40934	40939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008787	AAG	2	6	40950	40955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008787	TA	3	6	40975	40980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008787	AT	3	6	40992	40997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008787	ATTT	2	8	41015	41022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008787	TAGA	2	8	41051	41058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008787	TATTTA	2	12	41081	41092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008787	AT	4	8	41107	41114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008787	CAAG	2	8	41170	41177	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008787	TAA	2	6	41181	41186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008787	TCTTT	2	10	41228	41237	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_008787	TTA	2	6	41240	41245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008787	CTA	2	6	41246	41251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008787	AAG	2	6	41337	41342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008787	AAT	2	6	41388	41393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008787	A	6	6	41401	41406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008787	CTA	2	6	41413	41418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008787	TGG	2	6	41427	41432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008787	AAG	2	6	41496	41501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008787	TA	3	6	41558	41563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008787	AGAAA	2	10	41602	41611	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008787	GCG	2	6	41633	41638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008787	TAGC	2	8	41775	41782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008787	TGC	2	6	42088	42093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008787	GGA	2	6	42151	42156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008787	TC	3	6	42237	42242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008787	AT	3	6	42247	42252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008787	CAG	2	6	42361	42366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008787	GGC	2	6	42370	42375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008787	CGT	2	6	42389	42394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008787	AAC	2	6	42404	42409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008787	CTTA	2	8	42437	42444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008787	AGG	2	6	42478	42483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008787	AGC	2	6	42494	42499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008787	AAAG	2	8	42508	42515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008787	AGTA	2	8	42568	42575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008787	ATT	2	6	42605	42610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008787	AGT	2	6	42718	42723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008787	TG	3	6	42730	42735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008787	TAAT	2	8	42828	42835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008787	AGG	2	6	43033	43038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008787	GGAT	2	8	43098	43105	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008787	AGA	2	6	43106	43111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008787	CCGTA	2	10	43163	43172	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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